Если мне не изменяет память то так и есть, там процесс копирования разделен на несколько этапов из которых последним как раз и является "копирование плохих секторов", программа будет пытаться скопировать каждый проблемный сектор несколько раз (количество попыток можно установить в настройках), если будет возможность попробуйте все таки указать высокое число попыток и по возможности использовать другой контроллер что-бы уж точно быть уверенным что получили максимальный результат. А вообще если HDD в работе уже больше 6 лет и есть намек на проблемы, то стоит проверить хотя-бы поверхностное состояние используя CrystalDiskInfo или что-нибудь еще так как велика вероятность потерять вообще все файлы на этом диске.
